1899-ben, a múzeum ünnepélyes megnyitása alkalmából jelent meg Jósa Andrásnak a Szabolcsvármegyei muzeum ős- és középkori tárgyainak ismertetése című katalógusa. Ezt tekinthetjük múzeumunk első kiadványának. Jósa nagy hangsúlyt fektetett a régészeti eredmények publikálására mind a szakma, mind a nagyközönség számára. Tudományos dolgozatai az Archaeologiai Értesítőben láttak napvilágot. Népszerűsítő, figyelemfelkeltő írásait a helyi lapokban, elsősorban a Nyírvidékben tette közzé. A Jósa András nevét viselő múzeum szellemiségében követte alapítóját, amikor kiadványsorozatok indításával tudományos műhelyt kívánt maga köré szervezni. 1958-tól napjainkig közel 300 kötetet adott ki a múzeum. A Jósa András Múzeum kiadványai című sorozat monográfiái, valamint A nyíregyházi Jósa András Múzeum évkönyve a régészet, néprajz, helytörténet, művészet- és irodalomtörténet eredményeit közli. A múzeum állandó és időszaki kiállításaihoz kötődnek A Jósa András Múzeum kiállítási vezetői, valamint A Jósa András Múzeum képzőművészeti katalógusai című sorozat egyes darabjai. 1997-ben indult útjára a Régészeti gyűjtemények Nyíregyházán című sorozat, melyben a múzeum régészeti leletanyagai kerülnek publikálásra. Egy nemzetközi pályázat eredményeként születtek a Történelmi és kulturális kalauz című
sorozatunk településmonográfiái.
Kiadványaink nagyrésze online elérhető a Hungaricana adatbázisban (https://library.hungaricana.hu/hu/collection/muze_megy_szsz/), illetve egy részük megvásárolható a Kállay Gyűjtemény jegypénztárában, valamint megrendelhető a következő címen: kozonsegkapcsolat@josamuzeum.hu
